在五笔字型编码输入法中，选取了组字能力强、出现次数多的130个左右的部件作为基本字根，其余所有的字，包括那些虽然也能作为字根，但是在五笔字型中没有被选为基本字根的部件，在输入时都要经过拆分成基本字根的组合。
　　对选出的130多种基本字根，按照其起笔笔划，分成五个区。以横起笔的为第一区，以竖起笔的为第二区，以撇起笔的为第三区，以捺（点）起笔的为第四区，以折起笔的为第五区。（如下图）

每一区内的基本字根又分成五个位置，也以1、2、3、4、5表示。这样130多个基本字根就被分成了25类，每类平均5-6个基本字根。这25类基本字根安排在除Z键以外的A-Y的25个英文字母键上。五笔字型字根总表以及五笔字型键盘字根排列如下图所示。

在同一个键位上的几个基本字根中，选择一个具有代表性的字根，称为键名。下图中键位左上角的字根就是键名。

2. 五笔输入的编码规则

　　精心地选择基本字根，由基本字根组成的所有的汉字，然后有效地、科学地、严格地在目前计算机的输入键盘上实现汉字输入，这是输入法的基本思想。五笔字型输入法一般击四键完成一个汉字的输入，编码规则总表如下图所示。

编码规则分成两大类：

　　(1)基本字根编码

　　这类汉字直接标在字根键盘上，其中包括键名汉字和一般成字字根汉字两种。键名汉字指：
　　王、土、大、木、工、目、日、口、田、山、言、立、水、火、之、禾、白、月、人、金、子、女、又、纟
　　共25个。它们采用把该键连敲四次的方法输入。
　　一般成字字根的汉字输入采用先敲字根所在键一次(称为挂号)，然后再敲该字字根的第一、第二以及最末一个单笔按键。例如：石，第一键为“石”字根所在的D，二键为首笔“横”G键，第三键为次笔“撇”T键，第四键为末笔“横”G键。
　　但对于用单笔划构成的字，如“一”、“|”、“丿”、“丶”、“乙”等，第一、二键是相同的，规定后面增加两个英文LL键。这样“一”、“|”、“丿”、“丶”、“乙”等的单独编码为：
　　一：GGLL 　　|：HHLL　　 丿：TTLL　 　丶：YYLL　 　乙：NNLL

(2)复合汉字编码

　　凡是由基本字根(包括笔型字根)组合而成的汉字，都必须拆分成基本字根的一维数列，然后再依次键入计算机。
　　例如：“新”字要拆分成：立、木、斤；“灭”要拆分成：一、火；“未”拆分成：二、小等。拆分要有一定的规则，才能最大限度地保持其唯一性。

　　1)拆分的基本规则

　　a．按书写顺序
　　例如：“新”字要拆分成：立、木、斤，而不能拆分成立、斤、木；“想”拆分成木、目、心，而不是木、心、目等，以保证字根序列的顺序性。
　　b．能散不连，能连不交
　　例如：“于”字拆分为一、十，而不能拆分为二、丨。因为后者两个字根之间的关系为交而前者是“散”。拆分时遵守“散”比“连”优先“连”比“交”优先的原则。
　　c．取大优先
　　保证在书写顺序下拆分成尽可能大的基本字根，使字根数目最少。所谓最大字根是指如果增加一个笔划，则不成其基本字根的字根。例如：“果”拆分为日、木；而不拆分为旦、小。
　　d．兼顾直观
　　例如：“自”字拆分成：丿、目； 而不拆分为：白 、一等，后者欠直观。

　　2)复合字编码规则

　　按上述原则拆分以后，按字根的多少分别处理：
　　a．刚好四字根，依次取该四个字根的码输入。
　　例如：“到”字拆分成“一、厶、土、刂”，则其编码为GCFJ。
　　b．超过四个字根，则取一、二、三、末四个字根的编码输入。
　　例如：“酸”字取“西、一 、厶 、文”编码为SGCT。
　　c．不足四个字根，加上一个末笔字型交叉识别码，若仍不足四码，则加一空格键。

　　3)末笔字型交叉识别码

　　对于不足四码的汉字，例如：“汉”字拆分成“氵、又”只有IC两个码，因此要增加一个所谓末笔字型交叉识别码Y 。
　　我们举个例子来说明它的必需性。例如：“汀”字拆分成“氵、丁”，编码也为IS，“沐”字拆分成“氵、木”，编码也为IS；“洒”字拆分成“氵、西”编码也为IS。这是因为“木、丁、西”三个字根都是在S键上。就这样输入，计算机无法区分它们。
　　为了进一步区分这些字，五笔字型编码输入法中引入一个末笔字型交叉识别码，它是由字的末笔笔划和字型信息共同构成的。

末笔笔划只有五种，字型信息只有三类，因此末笔字型交叉识别码只有15种如上表所示。
　　从表中可见，“汉”字的交叉识别码为Y，“字”字的交叉识虽码为F，“沐、汀、洒”的交叉识虽码分别为Y、H、G。如果字根编码和末笔交叉识别码都一样，这些汉字称重码字。对重码字只有进行选择操作，才能获得需要的汉字。